螯肢亚门（Chelicerata）
身体较大，分为头胸部和腹部。具螯肢而无触角，是本亚门主要特征。口后第一对附肢为脚须（pedipalp），主要是爬行，兼有执握、感觉和咀嚼功用。用鳃、书鳃或用书肺、气管呼吸。寒武纪至现代。海生或陆生。
肢口纲（Merostomata）
身体由头胸部和腹部组成。末端体节伸出剑尾。由于胸部螫肢后的五对附肢的基部包围口部，形成咀嚼面，故得名“肢口”纲。其著名代表是剑尾亚纲（Xiphosura）的Limulus（鲎）和板足鲎亚纲（Eurypterida）中志留纪的Eurypterus（板足鲎）
蛛形纲（Arachnida）
身体分头胸和腹部两部分。头胸部具单眼数对，无复眼。呼吸器官司有书肺或气管，或两者同时存在。雌雄异体。大部分肉食，也有一些是植食的。绝大多数为陆生，少数为水生，营自由生活。志留纪至现代。
其中蝎目Scorpionida是本纲最古老的代表，但古代蝎类常与海生动物化石伴生在一起，说明它们可能生活在海水中。另外还有蜘蛛类（araneids）。